Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nptx1Q62443 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nptx1Q62443 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nptx1Q62443 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx1Q62443 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nptx1Q62443 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nptx1Q62443 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nptx1Q62443 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nptx1Q62443 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nptx1Q62443 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nptx1Q62443 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nptx1Q62443 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nptx1Q62443 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nptx1Q62443 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nptx1Q62443 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx1Q62443 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nptx1Q62443 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nptx1Q62443 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx1Q62443 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx1Q62443 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx1Q62443 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx1Q62443 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx1Q62443 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx1Q62443 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nptx1Q62443 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx1Q62443 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nptx1Q62443 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nptx1Q62443 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nptx1Q62443 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nptx1Q62443 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nptx1Q62443 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nptx1Q62443 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nptx1Q62443 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nptx1Q62443 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nptx1Q62443 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nptx1Q62443 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nptx1Q62443 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nptx1Q62443 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nptx1Q62443 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nptx1Q62443 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nptx1Q62443 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nptx1Q62443 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nptx1Q62443 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nptx1Q62443 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nptx1Q62443 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nptx1Q62443 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nptx1Q62443 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nptx1Q62443 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nptx1Q62443 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx1Q62443 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx1Q62443 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx1Q62443 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx1Q62443 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms