Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Sh3gl2Q62420 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Sh3gl2Q62420 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Sh3gl2Q62420 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sh3gl2Q62420 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Sh3gl2Q62420 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Sh3gl2Q62420 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Sh3gl2Q62420 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Sh3gl2Q62420 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sh3gl2Q62420 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Sh3gl2Q62420 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sh3gl2Q62420 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sh3gl2Q62420 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sh3gl2Q62420 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Sh3gl2Q62420 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Sh3gl2Q62420 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Sh3gl2Q62420 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Sh3gl2Q62420 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sh3gl2Q62420 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sh3gl2Q62420 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Sh3gl2Q62420 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sh3gl2Q62420 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Sh3gl2Q62420 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Sh3gl2Q62420 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sh3gl2Q62420 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Sh3gl2Q62420 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Sh3gl2Q62420 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Sh3gl2Q62420 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Sh3gl2Q62420 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Sh3gl2Q62420 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Sh3gl2Q62420 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Sh3gl2Q62420 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Sh3gl2Q62420 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sh3gl2Q62420 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Sh3gl2Q62420 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sh3gl2Q62420 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Sh3gl2Q62420 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Sh3gl2Q62420 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Sh3gl2Q62420 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Sh3gl2Q62420 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sh3gl2Q62420 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Sh3gl2Q62420 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Sh3gl2Q62420 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Sh3gl2Q62420 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Sh3gl2Q62420 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Sh3gl2Q62420 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Sh3gl2Q62420 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Sh3gl2Q62420 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Sh3gl2Q62420 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Sh3gl2Q62420 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Sh3gl2Q62420 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Sh3gl2Q62420 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Sh3gl2Q62420 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Sh3gl2Q62420 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Sh3gl2Q62420 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Sh3gl2Q62420 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms