Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
SpegQ62407 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
SpegQ62407 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
SpegQ62407 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
SpegQ62407 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
SpegQ62407 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
SpegQ62407 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,5■■□□□ 1,99
SpegQ62407 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
SpegQ62407 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
SpegQ62407 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
SpegQ62407 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
SpegQ62407 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
SpegQ62407 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
SpegQ62407 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
SpegQ62407 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
SpegQ62407 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
SpegQ62407 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
SpegQ62407 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
SpegQ62407 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
SpegQ62407 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
SpegQ62407 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
SpegQ62407 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
SpegQ62407 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
SpegQ62407 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
SpegQ62407 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
SpegQ62407 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SpegQ62407 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
SpegQ62407 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SpegQ62407 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
SpegQ62407 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
SpegQ62407 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
SpegQ62407 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
SpegQ62407 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
SpegQ62407 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
SpegQ62407 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
SpegQ62407 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
SpegQ62407 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
SpegQ62407 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
SpegQ62407 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
SpegQ62407 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
SpegQ62407 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SpegQ62407 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
SpegQ62407 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
SpegQ62407 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
SpegQ62407 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
SpegQ62407 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
SpegQ62407 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
SpegQ62407 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
SpegQ62407 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,69■■□□□ 1,86
SpegQ62407 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,66■■□□□ 1,86
SpegQ62407 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
SpegQ62407 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
SpegQ62407 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,85
SpegQ62407 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
SpegQ62407 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
SpegQ62407 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
SpegQ62407 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
SpegQ62407 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
SpegQ62407 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,55■■□□□ 1,84
SpegQ62407 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
SpegQ62407 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
SpegQ62407 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,5■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,49■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
SpegQ62407 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,46■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
SpegQ62407 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
SpegQ62407 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
SpegQ62407 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
SpegQ62407 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
SpegQ62407 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
SpegQ62407 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
SpegQ62407 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
SpegQ62407 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
SpegQ62407 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,33■■□□□ 1,81
SpegQ62407 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
SpegQ62407 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
SpegQ62407 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
SpegQ62407 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
SpegQ62407 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
SpegQ62407 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms