Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm38Q62176 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm38Q62176 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm38Q62176 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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