Protein–RNA interactions for Protein: Q61771

Kif3b, Kinesin-like protein KIF3B, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3bQ61771 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Kif3bQ61771 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Kif3bQ61771 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,68■■■■■ 4,26
Kif3bQ61771 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Kif3bQ61771 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Kif3bQ61771 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Kif3bQ61771 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Kif3bQ61771 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Kif3bQ61771 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,46■■■■■ 4,23
Kif3bQ61771 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Kif3bQ61771 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Kif3bQ61771 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Kif3bQ61771 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Kif3bQ61771 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,27■■■■■ 4,2
Kif3bQ61771 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41,23■■■■■ 4,19
Kif3bQ61771 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Kif3bQ61771 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41,2■■■■■ 4,19
Kif3bQ61771 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Kif3bQ61771 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Kif3bQ61771 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Kif3bQ61771 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Kif3bQ61771 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Kif3bQ61771 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41■■■■■ 4,15
Kif3bQ61771 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Kif3bQ61771 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Kif3bQ61771 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40,96■■■■■ 4,15
Kif3bQ61771 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40,93■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Kif3bQ61771 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Kif3bQ61771 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Kif3bQ61771 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Kif3bQ61771 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Kif3bQ61771 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Kif3bQ61771 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40,74■■■■■ 4,11
Kif3bQ61771 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Kif3bQ61771 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Kif3bQ61771 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Kif3bQ61771 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Kif3bQ61771 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Kif3bQ61771 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Kif3bQ61771 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Kif3bQ61771 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Kif3bQ61771 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Kif3bQ61771 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40,55■■■■■ 4,08
Kif3bQ61771 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Kif3bQ61771 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Kif3bQ61771 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40,45■■■■■ 4,07
Kif3bQ61771 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Kif3bQ61771 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
Kif3bQ61771 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Kif3bQ61771 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Kif3bQ61771 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Kif3bQ61771 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Kif3bQ61771 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,23■■■■■ 4,03
Kif3bQ61771 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Kif3bQ61771 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Kif3bQ61771 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Kif3bQ61771 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,1■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40,08■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Kif3bQ61771 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,05■■■■■ 4
Kif3bQ61771 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,02■■■■■ 4
Kif3bQ61771 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Kif3bQ61771 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Kif3bQ61771 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,98
Kif3bQ61771 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,98
Kif3bQ61771 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Kif3bQ61771 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Kif3bQ61771 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39,79■■■■□ 3,96
Kif3bQ61771 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39,79■■■■□ 3,96
Kif3bQ61771 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Kif3bQ61771 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39,78■■■■□ 3,96
Kif3bQ61771 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39,78■■■■□ 3,96
Kif3bQ61771 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39,74■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39,72■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Kif3bQ61771 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39,69■■■■□ 3,94
Kif3bQ61771 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Kif3bQ61771 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39,6■■■■□ 3,93
Kif3bQ61771 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Kif3bQ61771 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Kif3bQ61771 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC39,59■■■■□ 3,93
Kif3bQ61771 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Kif3bQ61771 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Kif3bQ61771 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Kif3bQ61771 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Kif3bQ61771 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,3 ms