Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rev3lQ61493 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rev3lQ61493 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rev3lQ61493 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rev3lQ61493 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rev3lQ61493 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rev3lQ61493 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rev3lQ61493 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rev3lQ61493 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rev3lQ61493 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rev3lQ61493 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rev3lQ61493 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rev3lQ61493 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rev3lQ61493 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rev3lQ61493 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rev3lQ61493 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rev3lQ61493 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rev3lQ61493 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rev3lQ61493 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rev3lQ61493 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rev3lQ61493 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rev3lQ61493 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rev3lQ61493 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rev3lQ61493 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rev3lQ61493 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rev3lQ61493 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rev3lQ61493 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rev3lQ61493 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rev3lQ61493 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rev3lQ61493 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rev3lQ61493 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rev3lQ61493 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rev3lQ61493 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rev3lQ61493 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rev3lQ61493 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rev3lQ61493 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rev3lQ61493 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rev3lQ61493 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rev3lQ61493 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rev3lQ61493 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rev3lQ61493 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rev3lQ61493 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rev3lQ61493 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rev3lQ61493 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rev3lQ61493 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rev3lQ61493 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rev3lQ61493 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rev3lQ61493 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rev3lQ61493 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rev3lQ61493 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rev3lQ61493 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rev3lQ61493 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rev3lQ61493 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rev3lQ61493 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rev3lQ61493 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rev3lQ61493 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rev3lQ61493 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rev3lQ61493 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rev3lQ61493 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rev3lQ61493 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rev3lQ61493 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rev3lQ61493 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms