Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
CcnhQ61458 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
CcnhQ61458 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
CcnhQ61458 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
CcnhQ61458 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
CcnhQ61458 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
CcnhQ61458 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
CcnhQ61458 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
CcnhQ61458 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
CcnhQ61458 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
CcnhQ61458 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
CcnhQ61458 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
CcnhQ61458 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
CcnhQ61458 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CcnhQ61458 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
CcnhQ61458 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
CcnhQ61458 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
CcnhQ61458 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
CcnhQ61458 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
CcnhQ61458 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
CcnhQ61458 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
CcnhQ61458 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
CcnhQ61458 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
CcnhQ61458 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
CcnhQ61458 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
CcnhQ61458 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,93■■■□□ 2,06
CcnhQ61458 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
CcnhQ61458 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
CcnhQ61458 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
CcnhQ61458 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
CcnhQ61458 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
CcnhQ61458 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
CcnhQ61458 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
CcnhQ61458 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CcnhQ61458 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
CcnhQ61458 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
CcnhQ61458 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
CcnhQ61458 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
CcnhQ61458 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
CcnhQ61458 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,56■■■□□ 2
CcnhQ61458 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
CcnhQ61458 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,55■■■□□ 2
CcnhQ61458 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
CcnhQ61458 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
CcnhQ61458 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
CcnhQ61458 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
CcnhQ61458 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
CcnhQ61458 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
CcnhQ61458 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
CcnhQ61458 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
CcnhQ61458 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CcnhQ61458 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
CcnhQ61458 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CcnhQ61458 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
CcnhQ61458 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
CcnhQ61458 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
CcnhQ61458 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
CcnhQ61458 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
CcnhQ61458 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
CcnhQ61458 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
CcnhQ61458 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
CcnhQ61458 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
CcnhQ61458 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
CcnhQ61458 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
CcnhQ61458 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
CcnhQ61458 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CcnhQ61458 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
CcnhQ61458 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,7 ms