Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Traf4Q61382 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Traf4Q61382 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Traf4Q61382 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Traf4Q61382 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Traf4Q61382 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Traf4Q61382 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Traf4Q61382 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Traf4Q61382 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Traf4Q61382 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Traf4Q61382 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Traf4Q61382 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Traf4Q61382 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Traf4Q61382 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Traf4Q61382 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Traf4Q61382 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Traf4Q61382 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Traf4Q61382 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Traf4Q61382 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Traf4Q61382 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Traf4Q61382 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Traf4Q61382 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Traf4Q61382 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Traf4Q61382 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Traf4Q61382 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Traf4Q61382 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Traf4Q61382 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Traf4Q61382 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Traf4Q61382 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Traf4Q61382 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Traf4Q61382 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Traf4Q61382 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Traf4Q61382 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Traf4Q61382 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Traf4Q61382 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Traf4Q61382 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Traf4Q61382 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Traf4Q61382 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Traf4Q61382 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Traf4Q61382 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Traf4Q61382 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Traf4Q61382 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Traf4Q61382 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Traf4Q61382 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Traf4Q61382 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Traf4Q61382 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Traf4Q61382 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Traf4Q61382 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Traf4Q61382 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Traf4Q61382 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Traf4Q61382 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Traf4Q61382 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Traf4Q61382 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Traf4Q61382 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Traf4Q61382 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Traf4Q61382 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Traf4Q61382 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Traf4Q61382 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Traf4Q61382 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Traf4Q61382 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Traf4Q61382 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Traf4Q61382 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
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