Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Ctnna2Q61301 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ctnna2Q61301 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ctnna2Q61301 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ctnna2Q61301 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ctnna2Q61301 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ctnna2Q61301 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ctnna2Q61301 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ctnna2Q61301 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ctnna2Q61301 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ctnna2Q61301 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ctnna2Q61301 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Ctnna2Q61301 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ctnna2Q61301 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ctnna2Q61301 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ctnna2Q61301 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ctnna2Q61301 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ctnna2Q61301 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ctnna2Q61301 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ctnna2Q61301 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ctnna2Q61301 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ctnna2Q61301 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ctnna2Q61301 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ctnna2Q61301 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ctnna2Q61301 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ctnna2Q61301 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ctnna2Q61301 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Ctnna2Q61301 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ctnna2Q61301 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Ctnna2Q61301 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ctnna2Q61301 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ctnna2Q61301 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ctnna2Q61301 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ctnna2Q61301 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ctnna2Q61301 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ctnna2Q61301 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ctnna2Q61301 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ctnna2Q61301 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ctnna2Q61301 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ctnna2Q61301 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ctnna2Q61301 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ctnna2Q61301 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ctnna2Q61301 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ctnna2Q61301 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ctnna2Q61301 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ctnna2Q61301 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ctnna2Q61301 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ctnna2Q61301 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ctnna2Q61301 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Ctnna2Q61301 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ctnna2Q61301 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ctnna2Q61301 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ctnna2Q61301 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ctnna2Q61301 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ctnna2Q61301 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ctnna2Q61301 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ctnna2Q61301 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ctnna2Q61301 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ctnna2Q61301 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Ctnna2Q61301 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,5 ms