Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ctnna2Q61301 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctnna2Q61301 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctnna2Q61301 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctnna2Q61301 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctnna2Q61301 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctnna2Q61301 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctnna2Q61301 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctnna2Q61301 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnna2Q61301 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctnna2Q61301 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctnna2Q61301 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctnna2Q61301 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctnna2Q61301 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ctnna2Q61301 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctnna2Q61301 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctnna2Q61301 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctnna2Q61301 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctnna2Q61301 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnna2Q61301 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnna2Q61301 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ctnna2Q61301 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ctnna2Q61301 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctnna2Q61301 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctnna2Q61301 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctnna2Q61301 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctnna2Q61301 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctnna2Q61301 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctnna2Q61301 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctnna2Q61301 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctnna2Q61301 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctnna2Q61301 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctnna2Q61301 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctnna2Q61301 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctnna2Q61301 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctnna2Q61301 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnna2Q61301 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnna2Q61301 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctnna2Q61301 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ctnna2Q61301 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctnna2Q61301 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctnna2Q61301 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ctnna2Q61301 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctnna2Q61301 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna2Q61301 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnna2Q61301 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnna2Q61301 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnna2Q61301 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctnna2Q61301 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnna2Q61301 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctnna2Q61301 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctnna2Q61301 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctnna2Q61301 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctnna2Q61301 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ctnna2Q61301 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctnna2Q61301 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctnna2Q61301 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnna2Q61301 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnna2Q61301 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ctnna2Q61301 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctnna2Q61301 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms