Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Pik3c2aQ61194 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Pik3c2aQ61194 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pik3c2aQ61194 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pik3c2aQ61194 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pik3c2aQ61194 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pik3c2aQ61194 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Pik3c2aQ61194 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pik3c2aQ61194 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pik3c2aQ61194 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pik3c2aQ61194 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Pik3c2aQ61194 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Pik3c2aQ61194 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pik3c2aQ61194 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Pik3c2aQ61194 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pik3c2aQ61194 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms