Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Lamb3Q61087 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Lamb3Q61087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lamb3Q61087 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Lamb3Q61087 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Lamb3Q61087 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lamb3Q61087 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lamb3Q61087 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lamb3Q61087 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lamb3Q61087 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Lamb3Q61087 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Lamb3Q61087 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Lamb3Q61087 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Lamb3Q61087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Lamb3Q61087 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Lamb3Q61087 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lamb3Q61087 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Lamb3Q61087 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Lamb3Q61087 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Lamb3Q61087 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lamb3Q61087 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Lamb3Q61087 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Lamb3Q61087 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Lamb3Q61087 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Lamb3Q61087 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Lamb3Q61087 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Lamb3Q61087 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Lamb3Q61087 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Lamb3Q61087 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lamb3Q61087 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lamb3Q61087 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lamb3Q61087 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Lamb3Q61087 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Lamb3Q61087 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Lamb3Q61087 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Lamb3Q61087 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lamb3Q61087 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lamb3Q61087 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Lamb3Q61087 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Lamb3Q61087 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lamb3Q61087 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lamb3Q61087 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Lamb3Q61087 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Lamb3Q61087 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lamb3Q61087 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lamb3Q61087 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Lamb3Q61087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Lamb3Q61087 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lamb3Q61087 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lamb3Q61087 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lamb3Q61087 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lamb3Q61087 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lamb3Q61087 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lamb3Q61087 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Lamb3Q61087 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Lamb3Q61087 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Lamb3Q61087 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Lamb3Q61087 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Lamb3Q61087 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Lamb3Q61087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Lamb3Q61087 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lamb3Q61087 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Lamb3Q61087 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Lamb3Q61087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Lamb3Q61087 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Lamb3Q61087 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Lamb3Q61087 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Lamb3Q61087 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Lamb3Q61087 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Lamb3Q61087 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms