Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxf1Q61080 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxf1Q61080 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxf1Q61080 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxf1Q61080 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxf1Q61080 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxf1Q61080 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxf1Q61080 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxf1Q61080 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxf1Q61080 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxf1Q61080 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxf1Q61080 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxf1Q61080 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxf1Q61080 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxf1Q61080 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxf1Q61080 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxf1Q61080 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxf1Q61080 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxf1Q61080 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxf1Q61080 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxf1Q61080 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxf1Q61080 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxf1Q61080 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxf1Q61080 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxf1Q61080 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxf1Q61080 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxf1Q61080 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxf1Q61080 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxf1Q61080 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxf1Q61080 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxf1Q61080 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxf1Q61080 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxf1Q61080 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxf1Q61080 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxf1Q61080 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxf1Q61080 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxf1Q61080 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxf1Q61080 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxf1Q61080 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxf1Q61080 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxf1Q61080 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxf1Q61080 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxf1Q61080 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxf1Q61080 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxf1Q61080 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxf1Q61080 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxf1Q61080 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxf1Q61080 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxf1Q61080 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxf1Q61080 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxf1Q61080 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxf1Q61080 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Foxf1Q61080 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxf1Q61080 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxf1Q61080 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms