Protein–RNA interactions for Protein: Q61066

Nr0b1, Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr0b1Q61066 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Nr0b1Q61066 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Nr0b1Q61066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Nr0b1Q61066 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Nr0b1Q61066 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Nr0b1Q61066 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nr0b1Q61066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nr0b1Q61066 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Nr0b1Q61066 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Nr0b1Q61066 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Nr0b1Q61066 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Nr0b1Q61066 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Nr0b1Q61066 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Nr0b1Q61066 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Nr0b1Q61066 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Nr0b1Q61066 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Nr0b1Q61066 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Nr0b1Q61066 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Nr0b1Q61066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Nr0b1Q61066 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Nr0b1Q61066 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Nr0b1Q61066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Nr0b1Q61066 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Nr0b1Q61066 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Nr0b1Q61066 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Nr0b1Q61066 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Nr0b1Q61066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Nr0b1Q61066 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Nr0b1Q61066 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Nr0b1Q61066 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Nr0b1Q61066 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Nr0b1Q61066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Nr0b1Q61066 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Nr0b1Q61066 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Nr0b1Q61066 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Nr0b1Q61066 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Nr0b1Q61066 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Nr0b1Q61066 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Nr0b1Q61066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Nr0b1Q61066 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Nr0b1Q61066 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Nr0b1Q61066 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Nr0b1Q61066 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Nr0b1Q61066 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Nr0b1Q61066 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Nr0b1Q61066 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Nr0b1Q61066 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Nr0b1Q61066 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Nr0b1Q61066 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Nr0b1Q61066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Nr0b1Q61066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Nr0b1Q61066 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Nr0b1Q61066 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Nr0b1Q61066 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Nr0b1Q61066 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Nr0b1Q61066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Nr0b1Q61066 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Nr0b1Q61066 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Nr0b1Q61066 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Nr0b1Q61066 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Nr0b1Q61066 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Nr0b1Q61066 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Nr0b1Q61066 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Nr0b1Q61066 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Nr0b1Q61066 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Nr0b1Q61066 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Nr0b1Q61066 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Nr0b1Q61066 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Nr0b1Q61066 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Nr0b1Q61066 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Nr0b1Q61066 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Nr0b1Q61066 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Nr0b1Q61066 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Nr0b1Q61066 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,2 ms