Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Als2clQ60I26 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Als2clQ60I26 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Als2clQ60I26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Als2clQ60I26 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Als2clQ60I26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Als2clQ60I26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Als2clQ60I26 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Als2clQ60I26 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Als2clQ60I26 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Als2clQ60I26 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Als2clQ60I26 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Als2clQ60I26 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Als2clQ60I26 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Als2clQ60I26 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Als2clQ60I26 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Als2clQ60I26 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Als2clQ60I26 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Als2clQ60I26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Als2clQ60I26 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Als2clQ60I26 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Als2clQ60I26 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Als2clQ60I26 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Als2clQ60I26 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Als2clQ60I26 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Als2clQ60I26 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Als2clQ60I26 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Als2clQ60I26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Als2clQ60I26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Als2clQ60I26 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Als2clQ60I26 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Als2clQ60I26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Als2clQ60I26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Als2clQ60I26 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Als2clQ60I26 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Als2clQ60I26 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Als2clQ60I26 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Als2clQ60I26 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Als2clQ60I26 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Als2clQ60I26 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Als2clQ60I26 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Als2clQ60I26 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Als2clQ60I26 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Als2clQ60I26 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Als2clQ60I26 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Als2clQ60I26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Als2clQ60I26 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Als2clQ60I26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Als2clQ60I26 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms