Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epha1Q60750 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha1Q60750 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha1Q60750 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha1Q60750 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha1Q60750 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha1Q60750 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha1Q60750 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epha1Q60750 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epha1Q60750 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epha1Q60750 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha1Q60750 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha1Q60750 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epha1Q60750 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha1Q60750 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha1Q60750 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Epha1Q60750 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha1Q60750 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha1Q60750 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha1Q60750 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha1Q60750 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epha1Q60750 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epha1Q60750 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha1Q60750 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha1Q60750 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epha1Q60750 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epha1Q60750 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Epha1Q60750 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epha1Q60750 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Epha1Q60750 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epha1Q60750 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epha1Q60750 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Epha1Q60750 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Epha1Q60750 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epha1Q60750 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epha1Q60750 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Epha1Q60750 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epha1Q60750 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Epha1Q60750 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epha1Q60750 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Epha1Q60750 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha1Q60750 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Epha1Q60750 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha1Q60750 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epha1Q60750 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epha1Q60750 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epha1Q60750 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Epha1Q60750 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Epha1Q60750 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha1Q60750 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epha1Q60750 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha1Q60750 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epha1Q60750 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epha1Q60750 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epha1Q60750 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Epha1Q60750 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha1Q60750 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha1Q60750 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epha1Q60750 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha1Q60750 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epha1Q60750 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epha1Q60750 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha1Q60750 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epha1Q60750 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha1Q60750 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha1Q60750 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha1Q60750 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epha1Q60750 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms