Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Epha1Q60750 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Epha1Q60750 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Epha1Q60750 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Epha1Q60750 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Epha1Q60750 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Epha1Q60750 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Epha1Q60750 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Epha1Q60750 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Epha1Q60750 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Epha1Q60750 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Epha1Q60750 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Epha1Q60750 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Epha1Q60750 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Epha1Q60750 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Epha1Q60750 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Epha1Q60750 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Epha1Q60750 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Epha1Q60750 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Epha1Q60750 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Epha1Q60750 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Epha1Q60750 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Epha1Q60750 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Epha1Q60750 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Epha1Q60750 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Epha1Q60750 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Epha1Q60750 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Epha1Q60750 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Epha1Q60750 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Epha1Q60750 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Epha1Q60750 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Epha1Q60750 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Epha1Q60750 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Epha1Q60750 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Epha1Q60750 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Epha1Q60750 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Epha1Q60750 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Epha1Q60750 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Epha1Q60750 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Epha1Q60750 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Epha1Q60750 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Epha1Q60750 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Epha1Q60750 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Epha1Q60750 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Epha1Q60750 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Epha1Q60750 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Epha1Q60750 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Epha1Q60750 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Epha1Q60750 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Epha1Q60750 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Epha1Q60750 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Epha1Q60750 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Epha1Q60750 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Epha1Q60750 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Epha1Q60750 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Epha1Q60750 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Epha1Q60750 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Epha1Q60750 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Epha1Q60750 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Epha1Q60750 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Epha1Q60750 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Epha1Q60750 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Epha1Q60750 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Epha1Q60750 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Epha1Q60750 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Epha1Q60750 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Epha1Q60750 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Epha1Q60750 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,08■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms