Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pabpn1lQ5XFR0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pabpn1lQ5XFR0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pabpn1lQ5XFR0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pabpn1lQ5XFR0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pabpn1lQ5XFR0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pabpn1lQ5XFR0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Pabpn1lQ5XFR0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pabpn1lQ5XFR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Pabpn1lQ5XFR0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Pabpn1lQ5XFR0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Pabpn1lQ5XFR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Pabpn1lQ5XFR0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Pabpn1lQ5XFR0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Pabpn1lQ5XFR0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pabpn1lQ5XFR0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Pabpn1lQ5XFR0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Pabpn1lQ5XFR0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pabpn1lQ5XFR0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pabpn1lQ5XFR0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Pabpn1lQ5XFR0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Pabpn1lQ5XFR0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Pabpn1lQ5XFR0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Pabpn1lQ5XFR0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Pabpn1lQ5XFR0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Pabpn1lQ5XFR0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Pabpn1lQ5XFR0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pabpn1lQ5XFR0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pabpn1lQ5XFR0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Pabpn1lQ5XFR0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Pabpn1lQ5XFR0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pabpn1lQ5XFR0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Pabpn1lQ5XFR0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Pabpn1lQ5XFR0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Pabpn1lQ5XFR0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Pabpn1lQ5XFR0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Pabpn1lQ5XFR0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pabpn1lQ5XFR0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Pabpn1lQ5XFR0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,3 ms