Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ggnbp2Q5SV77 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ggnbp2Q5SV77 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ggnbp2Q5SV77 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ggnbp2Q5SV77 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ggnbp2Q5SV77 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ggnbp2Q5SV77 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ggnbp2Q5SV77 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ggnbp2Q5SV77 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ggnbp2Q5SV77 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ggnbp2Q5SV77 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ggnbp2Q5SV77 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ggnbp2Q5SV77 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ggnbp2Q5SV77 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ggnbp2Q5SV77 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ggnbp2Q5SV77 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ggnbp2Q5SV77 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ggnbp2Q5SV77 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ggnbp2Q5SV77 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ggnbp2Q5SV77 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ggnbp2Q5SV77 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ggnbp2Q5SV77 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ggnbp2Q5SV77 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ggnbp2Q5SV77 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ggnbp2Q5SV77 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ggnbp2Q5SV77 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Ggnbp2Q5SV77 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ggnbp2Q5SV77 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ggnbp2Q5SV77 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ggnbp2Q5SV77 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ggnbp2Q5SV77 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ggnbp2Q5SV77 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ggnbp2Q5SV77 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ggnbp2Q5SV77 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ggnbp2Q5SV77 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ggnbp2Q5SV77 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ggnbp2Q5SV77 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ggnbp2Q5SV77 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ggnbp2Q5SV77 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ggnbp2Q5SV77 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ggnbp2Q5SV77 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ggnbp2Q5SV77 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Ggnbp2Q5SV77 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ggnbp2Q5SV77 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ggnbp2Q5SV77 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Ggnbp2Q5SV77 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ggnbp2Q5SV77 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ggnbp2Q5SV77 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ggnbp2Q5SV77 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ggnbp2Q5SV77 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ggnbp2Q5SV77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ggnbp2Q5SV77 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ggnbp2Q5SV77 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ggnbp2Q5SV77 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ggnbp2Q5SV77 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ggnbp2Q5SV77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ggnbp2Q5SV77 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ggnbp2Q5SV77 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ggnbp2Q5SV77 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ggnbp2Q5SV77 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ggnbp2Q5SV77 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ggnbp2Q5SV77 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ggnbp2Q5SV77 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ggnbp2Q5SV77 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ggnbp2Q5SV77 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ggnbp2Q5SV77 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ggnbp2Q5SV77 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ggnbp2Q5SV77 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ggnbp2Q5SV77 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ggnbp2Q5SV77 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ggnbp2Q5SV77 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ggnbp2Q5SV77 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ggnbp2Q5SV77 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ggnbp2Q5SV77 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ggnbp2Q5SV77 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ggnbp2Q5SV77 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms