Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zzef1Q5SSH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zzef1Q5SSH7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zzef1Q5SSH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zzef1Q5SSH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zzef1Q5SSH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zzef1Q5SSH7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zzef1Q5SSH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zzef1Q5SSH7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zzef1Q5SSH7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zzef1Q5SSH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zzef1Q5SSH7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zzef1Q5SSH7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zzef1Q5SSH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zzef1Q5SSH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zzef1Q5SSH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zzef1Q5SSH7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zzef1Q5SSH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zzef1Q5SSH7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zzef1Q5SSH7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zzef1Q5SSH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zzef1Q5SSH7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zzef1Q5SSH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zzef1Q5SSH7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zzef1Q5SSH7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zzef1Q5SSH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zzef1Q5SSH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zzef1Q5SSH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zzef1Q5SSH7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zzef1Q5SSH7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zzef1Q5SSH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zzef1Q5SSH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zzef1Q5SSH7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Zzef1Q5SSH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zzef1Q5SSH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zzef1Q5SSH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zzef1Q5SSH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zzef1Q5SSH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zzef1Q5SSH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zzef1Q5SSH7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zzef1Q5SSH7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zzef1Q5SSH7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zzef1Q5SSH7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zzef1Q5SSH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zzef1Q5SSH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zzef1Q5SSH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zzef1Q5SSH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zzef1Q5SSH7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zzef1Q5SSH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zzef1Q5SSH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zzef1Q5SSH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zzef1Q5SSH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zzef1Q5SSH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zzef1Q5SSH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zzef1Q5SSH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms