Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
5730522E02RikQ5SP45 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5730522E02RikQ5SP45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
5730522E02RikQ5SP45 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
5730522E02RikQ5SP45 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
5730522E02RikQ5SP45 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
5730522E02RikQ5SP45 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
5730522E02RikQ5SP45 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5730522E02RikQ5SP45 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
5730522E02RikQ5SP45 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5730522E02RikQ5SP45 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5730522E02RikQ5SP45 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5730522E02RikQ5SP45 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
5730522E02RikQ5SP45 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5730522E02RikQ5SP45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5730522E02RikQ5SP45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5730522E02RikQ5SP45 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5730522E02RikQ5SP45 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
5730522E02RikQ5SP45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5730522E02RikQ5SP45 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
5730522E02RikQ5SP45 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5730522E02RikQ5SP45 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5730522E02RikQ5SP45 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5730522E02RikQ5SP45 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5730522E02RikQ5SP45 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
5730522E02RikQ5SP45 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5730522E02RikQ5SP45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5730522E02RikQ5SP45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5730522E02RikQ5SP45 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5730522E02RikQ5SP45 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5730522E02RikQ5SP45 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
5730522E02RikQ5SP45 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5730522E02RikQ5SP45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5730522E02RikQ5SP45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5730522E02RikQ5SP45 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
5730522E02RikQ5SP45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
5730522E02RikQ5SP45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
5730522E02RikQ5SP45 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5730522E02RikQ5SP45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5730522E02RikQ5SP45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5730522E02RikQ5SP45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5730522E02RikQ5SP45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5730522E02RikQ5SP45 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5730522E02RikQ5SP45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5730522E02RikQ5SP45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730522E02RikQ5SP45 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730522E02RikQ5SP45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730522E02RikQ5SP45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730522E02RikQ5SP45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730522E02RikQ5SP45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730522E02RikQ5SP45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5730522E02RikQ5SP45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5730522E02RikQ5SP45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730522E02RikQ5SP45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms