Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bhlha9Q5RJB0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bhlha9Q5RJB0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bhlha9Q5RJB0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bhlha9Q5RJB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bhlha9Q5RJB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bhlha9Q5RJB0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bhlha9Q5RJB0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Bhlha9Q5RJB0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bhlha9Q5RJB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bhlha9Q5RJB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bhlha9Q5RJB0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bhlha9Q5RJB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bhlha9Q5RJB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bhlha9Q5RJB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bhlha9Q5RJB0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bhlha9Q5RJB0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bhlha9Q5RJB0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bhlha9Q5RJB0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bhlha9Q5RJB0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bhlha9Q5RJB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bhlha9Q5RJB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bhlha9Q5RJB0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Bhlha9Q5RJB0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bhlha9Q5RJB0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bhlha9Q5RJB0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bhlha9Q5RJB0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bhlha9Q5RJB0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bhlha9Q5RJB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bhlha9Q5RJB0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bhlha9Q5RJB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bhlha9Q5RJB0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bhlha9Q5RJB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bhlha9Q5RJB0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bhlha9Q5RJB0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Bhlha9Q5RJB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bhlha9Q5RJB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bhlha9Q5RJB0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bhlha9Q5RJB0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bhlha9Q5RJB0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bhlha9Q5RJB0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bhlha9Q5RJB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bhlha9Q5RJB0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bhlha9Q5RJB0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bhlha9Q5RJB0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bhlha9Q5RJB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bhlha9Q5RJB0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bhlha9Q5RJB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bhlha9Q5RJB0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bhlha9Q5RJB0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bhlha9Q5RJB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bhlha9Q5RJB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Bhlha9Q5RJB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 514.6 ms