Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trav8d-2Q5R1B6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trav8d-2Q5R1B6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trav8d-2Q5R1B6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trav8d-2Q5R1B6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trav8d-2Q5R1B6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trav8d-2Q5R1B6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trav8d-2Q5R1B6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trav8d-2Q5R1B6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trav8d-2Q5R1B6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trav8d-2Q5R1B6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trav8d-2Q5R1B6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trav8d-2Q5R1B6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trav8d-2Q5R1B6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trav8d-2Q5R1B6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trav8d-2Q5R1B6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trav8d-2Q5R1B6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trav8d-2Q5R1B6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trav8d-2Q5R1B6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trav8d-2Q5R1B6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trav8d-2Q5R1B6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trav8d-2Q5R1B6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trav8d-2Q5R1B6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trav8d-2Q5R1B6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trav8d-2Q5R1B6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trav8d-2Q5R1B6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trav8d-2Q5R1B6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trav8d-2Q5R1B6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trav8d-2Q5R1B6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trav8d-2Q5R1B6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trav8d-2Q5R1B6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trav8d-2Q5R1B6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trav8d-2Q5R1B6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trav8d-2Q5R1B6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trav8d-2Q5R1B6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trav8d-2Q5R1B6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trav8d-2Q5R1B6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trav8d-2Q5R1B6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trav8d-2Q5R1B6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trav8d-2Q5R1B6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trav8d-2Q5R1B6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trav8d-2Q5R1B6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trav8d-2Q5R1B6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trav8d-2Q5R1B6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trav8d-2Q5R1B6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trav8d-2Q5R1B6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trav8d-2Q5R1B6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trav8d-2Q5R1B6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trav8d-2Q5R1B6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trav8d-2Q5R1B6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trav8d-2Q5R1B6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trav8d-2Q5R1B6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms