Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trdv2-2Q5R1A4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trdv2-2Q5R1A4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trdv2-2Q5R1A4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trdv2-2Q5R1A4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trdv2-2Q5R1A4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trdv2-2Q5R1A4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv2-2Q5R1A4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trdv2-2Q5R1A4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trdv2-2Q5R1A4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trdv2-2Q5R1A4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trdv2-2Q5R1A4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trdv2-2Q5R1A4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trdv2-2Q5R1A4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trdv2-2Q5R1A4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trdv2-2Q5R1A4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trdv2-2Q5R1A4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv2-2Q5R1A4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv2-2Q5R1A4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trdv2-2Q5R1A4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trdv2-2Q5R1A4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms