Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Syne3Q4FZC9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Syne3Q4FZC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Syne3Q4FZC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syne3Q4FZC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Syne3Q4FZC9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Syne3Q4FZC9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Syne3Q4FZC9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Syne3Q4FZC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syne3Q4FZC9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syne3Q4FZC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syne3Q4FZC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syne3Q4FZC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Syne3Q4FZC9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Syne3Q4FZC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syne3Q4FZC9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syne3Q4FZC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syne3Q4FZC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syne3Q4FZC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syne3Q4FZC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syne3Q4FZC9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syne3Q4FZC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Syne3Q4FZC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syne3Q4FZC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syne3Q4FZC9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syne3Q4FZC9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Syne3Q4FZC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syne3Q4FZC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syne3Q4FZC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Syne3Q4FZC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syne3Q4FZC9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syne3Q4FZC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syne3Q4FZC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syne3Q4FZC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Syne3Q4FZC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syne3Q4FZC9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syne3Q4FZC9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Syne3Q4FZC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syne3Q4FZC9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syne3Q4FZC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syne3Q4FZC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syne3Q4FZC9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Syne3Q4FZC9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syne3Q4FZC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syne3Q4FZC9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syne3Q4FZC9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syne3Q4FZC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Syne3Q4FZC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syne3Q4FZC9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syne3Q4FZC9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Syne3Q4FZC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syne3Q4FZC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syne3Q4FZC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syne3Q4FZC9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Syne3Q4FZC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syne3Q4FZC9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syne3Q4FZC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syne3Q4FZC9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syne3Q4FZC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syne3Q4FZC9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syne3Q4FZC9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syne3Q4FZC9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syne3Q4FZC9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syne3Q4FZC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syne3Q4FZC9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syne3Q4FZC9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Syne3Q4FZC9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syne3Q4FZC9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syne3Q4FZC9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Syne3Q4FZC9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syne3Q4FZC9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syne3Q4FZC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Syne3Q4FZC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syne3Q4FZC9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syne3Q4FZC9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syne3Q4FZC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syne3Q4FZC9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms