Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Krtap9-3Q3V2C1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap9-3Q3V2C1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krtap9-3Q3V2C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap9-3Q3V2C1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Krtap9-3Q3V2C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap9-3Q3V2C1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap9-3Q3V2C1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap9-3Q3V2C1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap9-3Q3V2C1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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