Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed1Q3V009 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed1Q3V009 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmed1Q3V009 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed1Q3V009 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed1Q3V009 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmed1Q3V009 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed1Q3V009 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed1Q3V009 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmed1Q3V009 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmed1Q3V009 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmed1Q3V009 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmed1Q3V009 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed1Q3V009 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmed1Q3V009 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmed1Q3V009 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmed1Q3V009 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed1Q3V009 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed1Q3V009 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmed1Q3V009 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmed1Q3V009 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmed1Q3V009 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmed1Q3V009 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmed1Q3V009 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmed1Q3V009 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmed1Q3V009 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmed1Q3V009 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmed1Q3V009 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmed1Q3V009 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmed1Q3V009 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmed1Q3V009 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmed1Q3V009 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmed1Q3V009 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmed1Q3V009 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmed1Q3V009 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed1Q3V009 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed1Q3V009 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms