Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q3UZV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q3UZV7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UZV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UZV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UZV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UZV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UZV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UZV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UZV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UZV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UZV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UZV7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UZV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UZV7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UZV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UZV7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3UZV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3UZV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UZV7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms