Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2fbQ3UWQ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2fbQ3UWQ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2fbQ3UWQ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2fbQ3UWQ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ube2fbQ3UWQ3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2fbQ3UWQ3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2fbQ3UWQ3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2fbQ3UWQ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2fbQ3UWQ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2fbQ3UWQ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2fbQ3UWQ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2fbQ3UWQ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2fbQ3UWQ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2fbQ3UWQ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube2fbQ3UWQ3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2fbQ3UWQ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube2fbQ3UWQ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube2fbQ3UWQ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube2fbQ3UWQ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2fbQ3UWQ3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2fbQ3UWQ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube2fbQ3UWQ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2fbQ3UWQ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2fbQ3UWQ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube2fbQ3UWQ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2fbQ3UWQ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2fbQ3UWQ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2fbQ3UWQ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2fbQ3UWQ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2fbQ3UWQ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2fbQ3UWQ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube2fbQ3UWQ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2fbQ3UWQ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube2fbQ3UWQ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2fbQ3UWQ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2fbQ3UWQ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2fbQ3UWQ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2fbQ3UWQ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2fbQ3UWQ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2fbQ3UWQ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2fbQ3UWQ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms