Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf48Q3US17 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf48Q3US17 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf48Q3US17 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf48Q3US17 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf48Q3US17 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf48Q3US17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf48Q3US17 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf48Q3US17 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf48Q3US17 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf48Q3US17 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf48Q3US17 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf48Q3US17 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf48Q3US17 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Znf48Q3US17 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf48Q3US17 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf48Q3US17 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf48Q3US17 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf48Q3US17 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf48Q3US17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf48Q3US17 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf48Q3US17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf48Q3US17 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf48Q3US17 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf48Q3US17 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf48Q3US17 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf48Q3US17 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf48Q3US17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf48Q3US17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf48Q3US17 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf48Q3US17 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf48Q3US17 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf48Q3US17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf48Q3US17 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf48Q3US17 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf48Q3US17 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf48Q3US17 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf48Q3US17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf48Q3US17 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf48Q3US17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf48Q3US17 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf48Q3US17 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf48Q3US17 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf48Q3US17 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf48Q3US17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf48Q3US17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf48Q3US17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf48Q3US17 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf48Q3US17 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf48Q3US17 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf48Q3US17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf48Q3US17 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf48Q3US17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf48Q3US17 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf48Q3US17 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf48Q3US17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms