Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cln5Q3UMW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln5Q3UMW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cln5Q3UMW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln5Q3UMW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln5Q3UMW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cln5Q3UMW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cln5Q3UMW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cln5Q3UMW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cln5Q3UMW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cln5Q3UMW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cln5Q3UMW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cln5Q3UMW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cln5Q3UMW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cln5Q3UMW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cln5Q3UMW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cln5Q3UMW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cln5Q3UMW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cln5Q3UMW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cln5Q3UMW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cln5Q3UMW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cln5Q3UMW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cln5Q3UMW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cln5Q3UMW8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cln5Q3UMW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln5Q3UMW8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cln5Q3UMW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln5Q3UMW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln5Q3UMW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln5Q3UMW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln5Q3UMW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln5Q3UMW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cln5Q3UMW8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln5Q3UMW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln5Q3UMW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cln5Q3UMW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cln5Q3UMW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cln5Q3UMW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cln5Q3UMW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cln5Q3UMW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cln5Q3UMW8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cln5Q3UMW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cln5Q3UMW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cln5Q3UMW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln5Q3UMW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln5Q3UMW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln5Q3UMW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln5Q3UMW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln5Q3UMW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln5Q3UMW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln5Q3UMW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln5Q3UMW8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms