Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Parp3Q3ULW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Parp3Q3ULW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Parp3Q3ULW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Parp3Q3ULW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Parp3Q3ULW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Parp3Q3ULW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Parp3Q3ULW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Parp3Q3ULW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Parp3Q3ULW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Parp3Q3ULW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Parp3Q3ULW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Parp3Q3ULW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Parp3Q3ULW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Parp3Q3ULW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Parp3Q3ULW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Parp3Q3ULW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Parp3Q3ULW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Parp3Q3ULW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Parp3Q3ULW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Parp3Q3ULW8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Parp3Q3ULW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Parp3Q3ULW8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Parp3Q3ULW8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Parp3Q3ULW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Parp3Q3ULW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Parp3Q3ULW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Parp3Q3ULW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Parp3Q3ULW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Parp3Q3ULW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Parp3Q3ULW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Parp3Q3ULW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Parp3Q3ULW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Parp3Q3ULW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Parp3Q3ULW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Parp3Q3ULW8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Parp3Q3ULW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Parp3Q3ULW8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Parp3Q3ULW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Parp3Q3ULW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Parp3Q3ULW8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Parp3Q3ULW8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Parp3Q3ULW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Parp3Q3ULW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Parp3Q3ULW8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Parp3Q3ULW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Parp3Q3ULW8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Parp3Q3ULW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Parp3Q3ULW8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Parp3Q3ULW8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Parp3Q3ULW8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Parp3Q3ULW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Parp3Q3ULW8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Parp3Q3ULW8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Parp3Q3ULW8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Parp3Q3ULW8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Parp3Q3ULW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Parp3Q3ULW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Parp3Q3ULW8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
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