Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc33Q3ULW6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc33Q3ULW6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc33Q3ULW6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc33Q3ULW6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc33Q3ULW6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc33Q3ULW6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc33Q3ULW6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc33Q3ULW6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc33Q3ULW6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc33Q3ULW6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc33Q3ULW6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc33Q3ULW6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc33Q3ULW6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc33Q3ULW6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc33Q3ULW6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc33Q3ULW6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc33Q3ULW6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc33Q3ULW6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc33Q3ULW6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccdc33Q3ULW6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc33Q3ULW6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc33Q3ULW6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc33Q3ULW6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc33Q3ULW6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc33Q3ULW6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc33Q3ULW6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc33Q3ULW6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc33Q3ULW6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc33Q3ULW6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc33Q3ULW6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc33Q3ULW6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc33Q3ULW6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc33Q3ULW6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc33Q3ULW6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc33Q3ULW6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc33Q3ULW6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc33Q3ULW6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc33Q3ULW6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc33Q3ULW6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc33Q3ULW6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc33Q3ULW6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc33Q3ULW6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc33Q3ULW6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc33Q3ULW6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc33Q3ULW6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc33Q3ULW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc33Q3ULW6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc33Q3ULW6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc33Q3ULW6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc33Q3ULW6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms