Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Hdhd2Q3UGR5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Hdhd2Q3UGR5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hdhd2Q3UGR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hdhd2Q3UGR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Hdhd2Q3UGR5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Hdhd2Q3UGR5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hdhd2Q3UGR5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hdhd2Q3UGR5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hdhd2Q3UGR5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Hdhd2Q3UGR5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Hdhd2Q3UGR5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Hdhd2Q3UGR5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Hdhd2Q3UGR5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Hdhd2Q3UGR5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Hdhd2Q3UGR5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Hdhd2Q3UGR5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Hdhd2Q3UGR5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Hdhd2Q3UGR5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Hdhd2Q3UGR5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hdhd2Q3UGR5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Hdhd2Q3UGR5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hdhd2Q3UGR5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Hdhd2Q3UGR5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Hdhd2Q3UGR5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Hdhd2Q3UGR5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Hdhd2Q3UGR5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Hdhd2Q3UGR5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Hdhd2Q3UGR5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Hdhd2Q3UGR5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Hdhd2Q3UGR5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Hdhd2Q3UGR5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Hdhd2Q3UGR5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Hdhd2Q3UGR5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Hdhd2Q3UGR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Hdhd2Q3UGR5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Hdhd2Q3UGR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Hdhd2Q3UGR5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Hdhd2Q3UGR5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Hdhd2Q3UGR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Hdhd2Q3UGR5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Hdhd2Q3UGR5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hdhd2Q3UGR5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hdhd2Q3UGR5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hdhd2Q3UGR5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Hdhd2Q3UGR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hdhd2Q3UGR5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Hdhd2Q3UGR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Hdhd2Q3UGR5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Hdhd2Q3UGR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Hdhd2Q3UGR5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hdhd2Q3UGR5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hdhd2Q3UGR5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hdhd2Q3UGR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Hdhd2Q3UGR5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Hdhd2Q3UGR5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Hdhd2Q3UGR5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Hdhd2Q3UGR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Hdhd2Q3UGR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Hdhd2Q3UGR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Hdhd2Q3UGR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Hdhd2Q3UGR5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Hdhd2Q3UGR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Hdhd2Q3UGR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Hdhd2Q3UGR5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Hdhd2Q3UGR5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Hdhd2Q3UGR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Hdhd2Q3UGR5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms