Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rsph3aQ3UFY4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rsph3aQ3UFY4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rsph3aQ3UFY4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rsph3aQ3UFY4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rsph3aQ3UFY4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rsph3aQ3UFY4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rsph3aQ3UFY4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rsph3aQ3UFY4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rsph3aQ3UFY4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rsph3aQ3UFY4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rsph3aQ3UFY4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rsph3aQ3UFY4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rsph3aQ3UFY4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rsph3aQ3UFY4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rsph3aQ3UFY4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rsph3aQ3UFY4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rsph3aQ3UFY4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rsph3aQ3UFY4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rsph3aQ3UFY4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rsph3aQ3UFY4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rsph3aQ3UFY4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rsph3aQ3UFY4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsph3aQ3UFY4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rsph3aQ3UFY4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Rsph3aQ3UFY4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rsph3aQ3UFY4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rsph3aQ3UFY4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rsph3aQ3UFY4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rsph3aQ3UFY4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rsph3aQ3UFY4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rsph3aQ3UFY4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Rsph3aQ3UFY4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rsph3aQ3UFY4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rsph3aQ3UFY4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rsph3aQ3UFY4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rsph3aQ3UFY4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rsph3aQ3UFY4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rsph3aQ3UFY4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rsph3aQ3UFY4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rsph3aQ3UFY4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rsph3aQ3UFY4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rsph3aQ3UFY4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rsph3aQ3UFY4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rsph3aQ3UFY4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rsph3aQ3UFY4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rsph3aQ3UFY4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rsph3aQ3UFY4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rsph3aQ3UFY4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rsph3aQ3UFY4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rsph3aQ3UFY4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Rsph3aQ3UFY4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rsph3aQ3UFY4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rsph3aQ3UFY4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rsph3aQ3UFY4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rsph3aQ3UFY4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rsph3aQ3UFY4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 498.1 ms