Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Gtpbp6Q3U6U5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Gtpbp6Q3U6U5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Gtpbp6Q3U6U5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gtpbp6Q3U6U5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gtpbp6Q3U6U5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gtpbp6Q3U6U5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gtpbp6Q3U6U5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gtpbp6Q3U6U5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gtpbp6Q3U6U5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gtpbp6Q3U6U5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gtpbp6Q3U6U5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Gtpbp6Q3U6U5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gtpbp6Q3U6U5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gtpbp6Q3U6U5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gtpbp6Q3U6U5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gtpbp6Q3U6U5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gtpbp6Q3U6U5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gtpbp6Q3U6U5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gtpbp6Q3U6U5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gtpbp6Q3U6U5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Gtpbp6Q3U6U5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gtpbp6Q3U6U5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gtpbp6Q3U6U5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gtpbp6Q3U6U5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gtpbp6Q3U6U5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gtpbp6Q3U6U5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gtpbp6Q3U6U5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gtpbp6Q3U6U5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gtpbp6Q3U6U5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gtpbp6Q3U6U5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gtpbp6Q3U6U5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gtpbp6Q3U6U5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gtpbp6Q3U6U5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
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