Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cmpk2Q3U5Q7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cmpk2Q3U5Q7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmpk2Q3U5Q7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmpk2Q3U5Q7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cmpk2Q3U5Q7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cmpk2Q3U5Q7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmpk2Q3U5Q7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmpk2Q3U5Q7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmpk2Q3U5Q7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmpk2Q3U5Q7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmpk2Q3U5Q7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmpk2Q3U5Q7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmpk2Q3U5Q7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmpk2Q3U5Q7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmpk2Q3U5Q7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmpk2Q3U5Q7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cmpk2Q3U5Q7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cmpk2Q3U5Q7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cmpk2Q3U5Q7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cmpk2Q3U5Q7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cmpk2Q3U5Q7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmpk2Q3U5Q7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cmpk2Q3U5Q7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmpk2Q3U5Q7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmpk2Q3U5Q7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cmpk2Q3U5Q7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmpk2Q3U5Q7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmpk2Q3U5Q7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmpk2Q3U5Q7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmpk2Q3U5Q7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmpk2Q3U5Q7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmpk2Q3U5Q7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmpk2Q3U5Q7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmpk2Q3U5Q7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmpk2Q3U5Q7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmpk2Q3U5Q7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmpk2Q3U5Q7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cmpk2Q3U5Q7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cmpk2Q3U5Q7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cmpk2Q3U5Q7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cmpk2Q3U5Q7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmpk2Q3U5Q7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmpk2Q3U5Q7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cmpk2Q3U5Q7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmpk2Q3U5Q7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cmpk2Q3U5Q7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmpk2Q3U5Q7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmpk2Q3U5Q7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmpk2Q3U5Q7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmpk2Q3U5Q7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmpk2Q3U5Q7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms