Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ulk3Q3U3Q1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk3Q3U3Q1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk3Q3U3Q1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ulk3Q3U3Q1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ulk3Q3U3Q1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ulk3Q3U3Q1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ulk3Q3U3Q1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ulk3Q3U3Q1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk3Q3U3Q1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk3Q3U3Q1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk3Q3U3Q1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk3Q3U3Q1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk3Q3U3Q1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk3Q3U3Q1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ulk3Q3U3Q1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk3Q3U3Q1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk3Q3U3Q1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk3Q3U3Q1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk3Q3U3Q1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk3Q3U3Q1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk3Q3U3Q1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ulk3Q3U3Q1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk3Q3U3Q1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk3Q3U3Q1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk3Q3U3Q1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ulk3Q3U3Q1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ulk3Q3U3Q1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ulk3Q3U3Q1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk3Q3U3Q1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ulk3Q3U3Q1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk3Q3U3Q1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk3Q3U3Q1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ulk3Q3U3Q1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ulk3Q3U3Q1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ulk3Q3U3Q1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ulk3Q3U3Q1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ulk3Q3U3Q1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ulk3Q3U3Q1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ulk3Q3U3Q1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ulk3Q3U3Q1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ulk3Q3U3Q1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ulk3Q3U3Q1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ulk3Q3U3Q1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ulk3Q3U3Q1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ulk3Q3U3Q1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ulk3Q3U3Q1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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