Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pip4p1Q3TWL2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Pip4p1Q3TWL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Pip4p1Q3TWL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pip4p1Q3TWL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pip4p1Q3TWL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Pip4p1Q3TWL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pip4p1Q3TWL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pip4p1Q3TWL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pip4p1Q3TWL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Pip4p1Q3TWL2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Pip4p1Q3TWL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Pip4p1Q3TWL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Pip4p1Q3TWL2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Pip4p1Q3TWL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Pip4p1Q3TWL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Pip4p1Q3TWL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Pip4p1Q3TWL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Pip4p1Q3TWL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Pip4p1Q3TWL2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Pip4p1Q3TWL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Pip4p1Q3TWL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Pip4p1Q3TWL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Pip4p1Q3TWL2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Pip4p1Q3TWL2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Pip4p1Q3TWL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Pip4p1Q3TWL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Pip4p1Q3TWL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Pip4p1Q3TWL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Pip4p1Q3TWL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Pip4p1Q3TWL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Pip4p1Q3TWL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Pip4p1Q3TWL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Pip4p1Q3TWL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Pip4p1Q3TWL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Pip4p1Q3TWL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Pip4p1Q3TWL2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Pip4p1Q3TWL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Pip4p1Q3TWL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Pip4p1Q3TWL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Pip4p1Q3TWL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Pip4p1Q3TWL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
Pip4p1Q3TWL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Pip4p1Q3TWL2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Pip4p1Q3TWL2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Pip4p1Q3TWL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Pip4p1Q3TWL2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Pip4p1Q3TWL2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Pip4p1Q3TWL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Pip4p1Q3TWL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Pip4p1Q3TWL2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Pip4p1Q3TWL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Pip4p1Q3TWL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Pip4p1Q3TWL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Pip4p1Q3TWL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Pip4p1Q3TWL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Pip4p1Q3TWL2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Pip4p1Q3TWL2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Pip4p1Q3TWL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Pip4p1Q3TWL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Pip4p1Q3TWL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Pip4p1Q3TWL2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Pip4p1Q3TWL2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Pip4p1Q3TWL2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,4 ms