Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt2Q3TTY5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt2Q3TTY5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt2Q3TTY5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt2Q3TTY5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt2Q3TTY5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt2Q3TTY5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt2Q3TTY5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt2Q3TTY5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Krt2Q3TTY5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt2Q3TTY5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt2Q3TTY5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt2Q3TTY5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt2Q3TTY5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt2Q3TTY5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt2Q3TTY5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt2Q3TTY5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt2Q3TTY5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt2Q3TTY5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt2Q3TTY5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt2Q3TTY5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt2Q3TTY5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt2Q3TTY5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt2Q3TTY5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt2Q3TTY5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt2Q3TTY5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt2Q3TTY5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt2Q3TTY5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt2Q3TTY5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt2Q3TTY5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt2Q3TTY5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt2Q3TTY5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt2Q3TTY5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt2Q3TTY5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt2Q3TTY5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt2Q3TTY5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt2Q3TTY5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt2Q3TTY5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt2Q3TTY5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt2Q3TTY5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt2Q3TTY5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt2Q3TTY5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt2Q3TTY5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt2Q3TTY5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt2Q3TTY5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt2Q3TTY5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt2Q3TTY5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt2Q3TTY5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt2Q3TTY5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt2Q3TTY5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt2Q3TTY5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt2Q3TTY5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt2Q3TTY5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt2Q3TTY5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms