Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prrc2cQ3TLH4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2cQ3TLH4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2cQ3TLH4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2cQ3TLH4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2cQ3TLH4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2cQ3TLH4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2cQ3TLH4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prrc2cQ3TLH4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2cQ3TLH4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2cQ3TLH4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2cQ3TLH4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2cQ3TLH4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2cQ3TLH4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2cQ3TLH4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrc2cQ3TLH4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2cQ3TLH4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2cQ3TLH4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2cQ3TLH4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2cQ3TLH4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2cQ3TLH4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2cQ3TLH4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2cQ3TLH4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2cQ3TLH4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2cQ3TLH4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prrc2cQ3TLH4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2cQ3TLH4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2cQ3TLH4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2cQ3TLH4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2cQ3TLH4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2cQ3TLH4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2cQ3TLH4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2cQ3TLH4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2cQ3TLH4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prrc2cQ3TLH4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2cQ3TLH4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2cQ3TLH4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2cQ3TLH4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2cQ3TLH4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrc2cQ3TLH4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2cQ3TLH4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2cQ3TLH4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2cQ3TLH4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2cQ3TLH4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2cQ3TLH4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2cQ3TLH4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prrc2cQ3TLH4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2cQ3TLH4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms