Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim43aQ3TL54 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim43aQ3TL54 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim43aQ3TL54 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim43aQ3TL54 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim43aQ3TL54 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim43aQ3TL54 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim43aQ3TL54 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim43aQ3TL54 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim43aQ3TL54 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim43aQ3TL54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim43aQ3TL54 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim43aQ3TL54 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim43aQ3TL54 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim43aQ3TL54 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim43aQ3TL54 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim43aQ3TL54 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim43aQ3TL54 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim43aQ3TL54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim43aQ3TL54 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim43aQ3TL54 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim43aQ3TL54 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim43aQ3TL54 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim43aQ3TL54 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim43aQ3TL54 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim43aQ3TL54 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trim43aQ3TL54 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim43aQ3TL54 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim43aQ3TL54 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim43aQ3TL54 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim43aQ3TL54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim43aQ3TL54 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trim43aQ3TL54 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim43aQ3TL54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim43aQ3TL54 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim43aQ3TL54 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim43aQ3TL54 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim43aQ3TL54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim43aQ3TL54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim43aQ3TL54 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim43aQ3TL54 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim43aQ3TL54 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim43aQ3TL54 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim43aQ3TL54 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim43aQ3TL54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim43aQ3TL54 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim43aQ3TL54 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim43aQ3TL54 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim43aQ3TL54 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim43aQ3TL54 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim43aQ3TL54 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim43aQ3TL54 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trim43aQ3TL54 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim43aQ3TL54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim43aQ3TL54 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim43aQ3TL54 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim43aQ3TL54 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim43aQ3TL54 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim43aQ3TL54 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim43aQ3TL54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim43aQ3TL54 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim43aQ3TL54 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim43aQ3TL54 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim43aQ3TL54 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim43aQ3TL54 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43aQ3TL54 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim43aQ3TL54 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim43aQ3TL54 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim43aQ3TL54 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim43aQ3TL54 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim43aQ3TL54 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim43aQ3TL54 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim43aQ3TL54 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms