Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Eepd1Q3TGW2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Eepd1Q3TGW2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Eepd1Q3TGW2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Eepd1Q3TGW2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Eepd1Q3TGW2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Eepd1Q3TGW2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Eepd1Q3TGW2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Eepd1Q3TGW2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Eepd1Q3TGW2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Eepd1Q3TGW2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Eepd1Q3TGW2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Eepd1Q3TGW2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Eepd1Q3TGW2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Eepd1Q3TGW2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Eepd1Q3TGW2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Eepd1Q3TGW2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Eepd1Q3TGW2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Eepd1Q3TGW2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Eepd1Q3TGW2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Eepd1Q3TGW2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Eepd1Q3TGW2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Eepd1Q3TGW2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Eepd1Q3TGW2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Eepd1Q3TGW2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Eepd1Q3TGW2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Eepd1Q3TGW2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Eepd1Q3TGW2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Eepd1Q3TGW2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Eepd1Q3TGW2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Eepd1Q3TGW2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Eepd1Q3TGW2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Eepd1Q3TGW2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Eepd1Q3TGW2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Eepd1Q3TGW2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Eepd1Q3TGW2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Eepd1Q3TGW2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Eepd1Q3TGW2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Eepd1Q3TGW2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Eepd1Q3TGW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Eepd1Q3TGW2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Eepd1Q3TGW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Eepd1Q3TGW2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Eepd1Q3TGW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Eepd1Q3TGW2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Eepd1Q3TGW2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Eepd1Q3TGW2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Eepd1Q3TGW2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Eepd1Q3TGW2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Eepd1Q3TGW2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Eepd1Q3TGW2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Eepd1Q3TGW2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Eepd1Q3TGW2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Eepd1Q3TGW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Eepd1Q3TGW2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Eepd1Q3TGW2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Eepd1Q3TGW2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Eepd1Q3TGW2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Eepd1Q3TGW2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Eepd1Q3TGW2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Eepd1Q3TGW2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Eepd1Q3TGW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Eepd1Q3TGW2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Eepd1Q3TGW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Eepd1Q3TGW2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Eepd1Q3TGW2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,45■■■□□ 2,46
Eepd1Q3TGW2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Eepd1Q3TGW2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Eepd1Q3TGW2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Eepd1Q3TGW2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Eepd1Q3TGW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Eepd1Q3TGW2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Eepd1Q3TGW2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Eepd1Q3TGW2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Eepd1Q3TGW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Eepd1Q3TGW2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Eepd1Q3TGW2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms