Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAS6

Emc10, ER membrane protein complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc10Q3TAS6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Emc10Q3TAS6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Emc10Q3TAS6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Emc10Q3TAS6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Emc10Q3TAS6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Emc10Q3TAS6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Emc10Q3TAS6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Emc10Q3TAS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Emc10Q3TAS6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Emc10Q3TAS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Emc10Q3TAS6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Emc10Q3TAS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Emc10Q3TAS6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Emc10Q3TAS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Emc10Q3TAS6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Emc10Q3TAS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Emc10Q3TAS6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Emc10Q3TAS6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Emc10Q3TAS6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Emc10Q3TAS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Emc10Q3TAS6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Emc10Q3TAS6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Emc10Q3TAS6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Emc10Q3TAS6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Emc10Q3TAS6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Emc10Q3TAS6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Emc10Q3TAS6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Emc10Q3TAS6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Emc10Q3TAS6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Emc10Q3TAS6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Emc10Q3TAS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Emc10Q3TAS6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Emc10Q3TAS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Emc10Q3TAS6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Emc10Q3TAS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Emc10Q3TAS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Emc10Q3TAS6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Emc10Q3TAS6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Emc10Q3TAS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Emc10Q3TAS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Emc10Q3TAS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Emc10Q3TAS6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Emc10Q3TAS6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Emc10Q3TAS6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Emc10Q3TAS6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Emc10Q3TAS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Emc10Q3TAS6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Emc10Q3TAS6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Emc10Q3TAS6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Emc10Q3TAS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Emc10Q3TAS6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Emc10Q3TAS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Emc10Q3TAS6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Emc10Q3TAS6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Emc10Q3TAS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Emc10Q3TAS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Emc10Q3TAS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Emc10Q3TAS6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Emc10Q3TAS6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Emc10Q3TAS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Emc10Q3TAS6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Emc10Q3TAS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Emc10Q3TAS6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Emc10Q3TAS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms