Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Prex2Q3LAC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43,5■■■■■ 4,55
Prex2Q3LAC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,43■■■■■ 4,54
Prex2Q3LAC4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Prex2Q3LAC4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Prex2Q3LAC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
Prex2Q3LAC4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Prex2Q3LAC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Prex2Q3LAC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Prex2Q3LAC4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Prex2Q3LAC4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Prex2Q3LAC4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Prex2Q3LAC4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,1■■■■■ 4,49
Prex2Q3LAC4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Prex2Q3LAC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42,98■■■■■ 4,47
Prex2Q3LAC4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Prex2Q3LAC4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,93■■■■■ 4,46
Prex2Q3LAC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Prex2Q3LAC4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Prex2Q3LAC4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,86■■■■■ 4,45
Prex2Q3LAC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42,84■■■■■ 4,45
Prex2Q3LAC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Prex2Q3LAC4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,44
Prex2Q3LAC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Prex2Q3LAC4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Prex2Q3LAC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Prex2Q3LAC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Prex2Q3LAC4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Prex2Q3LAC4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Prex2Q3LAC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42,65■■■■■ 4,42
Prex2Q3LAC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,6■■■■■ 4,41
Prex2Q3LAC4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Prex2Q3LAC4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Prex2Q3LAC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Prex2Q3LAC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Prex2Q3LAC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42,54■■■■■ 4,4
Prex2Q3LAC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Prex2Q3LAC4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
Prex2Q3LAC4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Prex2Q3LAC4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Prex2Q3LAC4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Prex2Q3LAC4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42,38■■■■■ 4,37
Prex2Q3LAC4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Prex2Q3LAC4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42,37■■■■■ 4,37
Prex2Q3LAC4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
Prex2Q3LAC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,27■■■■■ 4,36
Prex2Q3LAC4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Prex2Q3LAC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42,23■■■■■ 4,35
Prex2Q3LAC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42,22■■■■■ 4,35
Prex2Q3LAC4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Prex2Q3LAC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Prex2Q3LAC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Prex2Q3LAC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,32
Prex2Q3LAC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,06■■■■■ 4,32
Prex2Q3LAC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Prex2Q3LAC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Prex2Q3LAC4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,04■■■■■ 4,32
Prex2Q3LAC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
Prex2Q3LAC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41,99■■■■■ 4,31
Prex2Q3LAC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Prex2Q3LAC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,97■■■■■ 4,31
Prex2Q3LAC4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,85■■■■■ 4,29
Prex2Q3LAC4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
Prex2Q3LAC4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Prex2Q3LAC4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Prex2Q3LAC4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Prex2Q3LAC4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
Prex2Q3LAC4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Prex2Q3LAC4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Prex2Q3LAC4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
Prex2Q3LAC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,66■■■■■ 4,26
Prex2Q3LAC4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
Prex2Q3LAC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,62■■■■■ 4,25
Prex2Q3LAC4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
Prex2Q3LAC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Prex2Q3LAC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Prex2Q3LAC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Prex2Q3LAC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41,54■■■■■ 4,24
Prex2Q3LAC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Prex2Q3LAC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41,49■■■■■ 4,23
Prex2Q3LAC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Prex2Q3LAC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Prex2Q3LAC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41,46■■■■■ 4,23
Prex2Q3LAC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Prex2Q3LAC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41,4■■■■■ 4,22
Prex2Q3LAC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Prex2Q3LAC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41,33■■■■■ 4,21
Prex2Q3LAC4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Prex2Q3LAC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41,31■■■■■ 4,2
Prex2Q3LAC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Prex2Q3LAC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Prex2Q3LAC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Prex2Q3LAC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Prex2Q3LAC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Prex2Q3LAC4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Prex2Q3LAC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Prex2Q3LAC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Prex2Q3LAC4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,16■■■■■ 4,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms