Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Prex2Q3LAC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Prex2Q3LAC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
Prex2Q3LAC4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Prex2Q3LAC4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Prex2Q3LAC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Prex2Q3LAC4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Prex2Q3LAC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Prex2Q3LAC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Prex2Q3LAC4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Prex2Q3LAC4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Prex2Q3LAC4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Prex2Q3LAC4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
Prex2Q3LAC4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Prex2Q3LAC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Prex2Q3LAC4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Prex2Q3LAC4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Prex2Q3LAC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Prex2Q3LAC4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Prex2Q3LAC4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Prex2Q3LAC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
Prex2Q3LAC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Prex2Q3LAC4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Prex2Q3LAC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Prex2Q3LAC4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Prex2Q3LAC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Prex2Q3LAC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Prex2Q3LAC4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Prex2Q3LAC4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Prex2Q3LAC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Prex2Q3LAC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Prex2Q3LAC4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Prex2Q3LAC4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Prex2Q3LAC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Prex2Q3LAC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Prex2Q3LAC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Prex2Q3LAC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Prex2Q3LAC4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Prex2Q3LAC4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Prex2Q3LAC4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Prex2Q3LAC4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Prex2Q3LAC4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Prex2Q3LAC4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Prex2Q3LAC4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
Prex2Q3LAC4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Prex2Q3LAC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Prex2Q3LAC4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Prex2Q3LAC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Prex2Q3LAC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
Prex2Q3LAC4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Prex2Q3LAC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Prex2Q3LAC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Prex2Q3LAC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Prex2Q3LAC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Prex2Q3LAC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Prex2Q3LAC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Prex2Q3LAC4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Prex2Q3LAC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Prex2Q3LAC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Prex2Q3LAC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Prex2Q3LAC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Prex2Q3LAC4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Prex2Q3LAC4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Prex2Q3LAC4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Prex2Q3LAC4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Prex2Q3LAC4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Prex2Q3LAC4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Prex2Q3LAC4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Prex2Q3LAC4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Prex2Q3LAC4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Prex2Q3LAC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Prex2Q3LAC4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Prex2Q3LAC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Prex2Q3LAC4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Prex2Q3LAC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Prex2Q3LAC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Prex2Q3LAC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Prex2Q3LAC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Prex2Q3LAC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Prex2Q3LAC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Prex2Q3LAC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Prex2Q3LAC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Prex2Q3LAC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
Prex2Q3LAC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Prex2Q3LAC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Prex2Q3LAC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Prex2Q3LAC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Prex2Q3LAC4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Prex2Q3LAC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Prex2Q3LAC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Prex2Q3LAC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Prex2Q3LAC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Prex2Q3LAC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Prex2Q3LAC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Prex2Q3LAC4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Prex2Q3LAC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Prex2Q3LAC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Prex2Q3LAC4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms