Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Defa26Q3L180 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Defa26Q3L180 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Defa26Q3L180 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Defa26Q3L180 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Defa26Q3L180 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Defa26Q3L180 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Defa26Q3L180 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Defa26Q3L180 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Defa26Q3L180 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Defa26Q3L180 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Defa26Q3L180 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Defa26Q3L180 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Defa26Q3L180 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Defa26Q3L180 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Defa26Q3L180 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Defa26Q3L180 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Defa26Q3L180 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Defa26Q3L180 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Defa26Q3L180 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Defa26Q3L180 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Defa26Q3L180 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Defa26Q3L180 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Defa26Q3L180 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Defa26Q3L180 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Defa26Q3L180 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Defa26Q3L180 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Defa26Q3L180 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Defa26Q3L180 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Defa26Q3L180 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Defa26Q3L180 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Defa26Q3L180 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Defa26Q3L180 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Defa26Q3L180 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Defa26Q3L180 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Defa26Q3L180 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Defa26Q3L180 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Defa26Q3L180 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
Defa26Q3L180 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Defa26Q3L180 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Defa26Q3L180 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Defa26Q3L180 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Defa26Q3L180 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Defa26Q3L180 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Defa26Q3L180 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,25■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Defa26Q3L180 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Defa26Q3L180 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Defa26Q3L180 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Defa26Q3L180 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Defa26Q3L180 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Defa26Q3L180 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Defa26Q3L180 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Defa26Q3L180 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Defa26Q3L180 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Defa26Q3L180 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Defa26Q3L180 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Defa26Q3L180 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Defa26Q3L180 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Defa26Q3L180 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,7 ms