Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Chrna5Q2MKA5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Chrna5Q2MKA5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Chrna5Q2MKA5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Chrna5Q2MKA5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Chrna5Q2MKA5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Chrna5Q2MKA5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Chrna5Q2MKA5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Chrna5Q2MKA5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Chrna5Q2MKA5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Chrna5Q2MKA5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Chrna5Q2MKA5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Chrna5Q2MKA5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Chrna5Q2MKA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Chrna5Q2MKA5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Chrna5Q2MKA5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Chrna5Q2MKA5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Chrna5Q2MKA5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Chrna5Q2MKA5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Chrna5Q2MKA5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Chrna5Q2MKA5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Chrna5Q2MKA5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Chrna5Q2MKA5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Chrna5Q2MKA5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Chrna5Q2MKA5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Chrna5Q2MKA5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Chrna5Q2MKA5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Chrna5Q2MKA5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Chrna5Q2MKA5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Chrna5Q2MKA5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Chrna5Q2MKA5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Chrna5Q2MKA5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Chrna5Q2MKA5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Chrna5Q2MKA5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Chrna5Q2MKA5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Chrna5Q2MKA5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Chrna5Q2MKA5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Chrna5Q2MKA5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Chrna5Q2MKA5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Chrna5Q2MKA5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,45■■■□□ 2,95
Chrna5Q2MKA5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Chrna5Q2MKA5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Chrna5Q2MKA5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Chrna5Q2MKA5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Chrna5Q2MKA5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Chrna5Q2MKA5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Chrna5Q2MKA5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Chrna5Q2MKA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Chrna5Q2MKA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Chrna5Q2MKA5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Chrna5Q2MKA5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Chrna5Q2MKA5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Chrna5Q2MKA5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,89
Chrna5Q2MKA5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Chrna5Q2MKA5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Chrna5Q2MKA5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Chrna5Q2MKA5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Chrna5Q2MKA5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Chrna5Q2MKA5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Chrna5Q2MKA5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Chrna5Q2MKA5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chrna5Q2MKA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Chrna5Q2MKA5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Chrna5Q2MKA5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Chrna5Q2MKA5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Chrna5Q2MKA5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Chrna5Q2MKA5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Chrna5Q2MKA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Chrna5Q2MKA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Chrna5Q2MKA5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Chrna5Q2MKA5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Chrna5Q2MKA5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Chrna5Q2MKA5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,2 ms