Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim71Q1PSW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim71Q1PSW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim71Q1PSW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim71Q1PSW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim71Q1PSW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim71Q1PSW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim71Q1PSW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim71Q1PSW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim71Q1PSW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim71Q1PSW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim71Q1PSW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim71Q1PSW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim71Q1PSW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim71Q1PSW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim71Q1PSW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim71Q1PSW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim71Q1PSW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim71Q1PSW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim71Q1PSW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim71Q1PSW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim71Q1PSW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim71Q1PSW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim71Q1PSW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim71Q1PSW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim71Q1PSW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim71Q1PSW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim71Q1PSW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim71Q1PSW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim71Q1PSW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim71Q1PSW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim71Q1PSW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim71Q1PSW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim71Q1PSW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim71Q1PSW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim71Q1PSW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim71Q1PSW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim71Q1PSW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim71Q1PSW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim71Q1PSW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim71Q1PSW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim71Q1PSW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim71Q1PSW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim71Q1PSW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim71Q1PSW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim71Q1PSW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim71Q1PSW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim71Q1PSW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim71Q1PSW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim71Q1PSW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim71Q1PSW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim71Q1PSW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim71Q1PSW8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim71Q1PSW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim71Q1PSW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim71Q1PSW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim71Q1PSW8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim71Q1PSW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim71Q1PSW8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim71Q1PSW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim71Q1PSW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim71Q1PSW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim71Q1PSW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim71Q1PSW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim71Q1PSW8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim71Q1PSW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim71Q1PSW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim71Q1PSW8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim71Q1PSW8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim71Q1PSW8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim71Q1PSW8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim71Q1PSW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim71Q1PSW8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim71Q1PSW8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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