Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd300lgQ1ERP8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd300lgQ1ERP8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cd300lgQ1ERP8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd300lgQ1ERP8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd300lgQ1ERP8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd300lgQ1ERP8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd300lgQ1ERP8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd300lgQ1ERP8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd300lgQ1ERP8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cd300lgQ1ERP8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd300lgQ1ERP8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd300lgQ1ERP8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd300lgQ1ERP8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd300lgQ1ERP8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd300lgQ1ERP8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd300lgQ1ERP8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cd300lgQ1ERP8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd300lgQ1ERP8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd300lgQ1ERP8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd300lgQ1ERP8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cd300lgQ1ERP8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd300lgQ1ERP8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd300lgQ1ERP8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cd300lgQ1ERP8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cd300lgQ1ERP8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd300lgQ1ERP8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd300lgQ1ERP8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd300lgQ1ERP8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd300lgQ1ERP8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd300lgQ1ERP8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd300lgQ1ERP8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd300lgQ1ERP8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cd300lgQ1ERP8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd300lgQ1ERP8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd300lgQ1ERP8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd300lgQ1ERP8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd300lgQ1ERP8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd300lgQ1ERP8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd300lgQ1ERP8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd300lgQ1ERP8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cd300lgQ1ERP8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd300lgQ1ERP8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd300lgQ1ERP8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd300lgQ1ERP8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd300lgQ1ERP8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd300lgQ1ERP8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd300lgQ1ERP8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd300lgQ1ERP8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd300lgQ1ERP8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd300lgQ1ERP8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd300lgQ1ERP8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd300lgQ1ERP8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd300lgQ1ERP8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd300lgQ1ERP8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd300lgQ1ERP8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd300lgQ1ERP8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd300lgQ1ERP8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd300lgQ1ERP8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd300lgQ1ERP8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd300lgQ1ERP8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd300lgQ1ERP8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd300lgQ1ERP8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd300lgQ1ERP8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd300lgQ1ERP8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd300lgQ1ERP8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cd300lgQ1ERP8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd300lgQ1ERP8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd300lgQ1ERP8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cd300lgQ1ERP8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cd300lgQ1ERP8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd300lgQ1ERP8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cd300lgQ1ERP8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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