Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klrb1Q0ZUP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klrb1Q0ZUP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Klrb1Q0ZUP1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klrb1Q0ZUP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klrb1Q0ZUP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klrb1Q0ZUP1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klrb1Q0ZUP1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klrb1Q0ZUP1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klrb1Q0ZUP1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Klrb1Q0ZUP1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Klrb1Q0ZUP1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Klrb1Q0ZUP1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klrb1Q0ZUP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klrb1Q0ZUP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klrb1Q0ZUP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Klrb1Q0ZUP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Klrb1Q0ZUP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klrb1Q0ZUP1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klrb1Q0ZUP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klrb1Q0ZUP1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klrb1Q0ZUP1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klrb1Q0ZUP1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klrb1Q0ZUP1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Klrb1Q0ZUP1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klrb1Q0ZUP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klrb1Q0ZUP1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klrb1Q0ZUP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrb1Q0ZUP1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrb1Q0ZUP1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klrb1Q0ZUP1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klrb1Q0ZUP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrb1Q0ZUP1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrb1Q0ZUP1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrb1Q0ZUP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klrb1Q0ZUP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrb1Q0ZUP1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klrb1Q0ZUP1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrb1Q0ZUP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klrb1Q0ZUP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klrb1Q0ZUP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klrb1Q0ZUP1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Klrb1Q0ZUP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klrb1Q0ZUP1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klrb1Q0ZUP1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Klrb1Q0ZUP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms