Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Col19a1Q0VF58 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Col19a1Q0VF58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Col19a1Q0VF58 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Col19a1Q0VF58 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Col19a1Q0VF58 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Col19a1Q0VF58 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Col19a1Q0VF58 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Col19a1Q0VF58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Col19a1Q0VF58 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Col19a1Q0VF58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col19a1Q0VF58 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Col19a1Q0VF58 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col19a1Q0VF58 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col19a1Q0VF58 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col19a1Q0VF58 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col19a1Q0VF58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col19a1Q0VF58 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col19a1Q0VF58 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col19a1Q0VF58 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Col19a1Q0VF58 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Col19a1Q0VF58 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col19a1Q0VF58 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col19a1Q0VF58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Col19a1Q0VF58 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Col19a1Q0VF58 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Col19a1Q0VF58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Col19a1Q0VF58 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Col19a1Q0VF58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col19a1Q0VF58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col19a1Q0VF58 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col19a1Q0VF58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col19a1Q0VF58 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Col19a1Q0VF58 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Col19a1Q0VF58 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col19a1Q0VF58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col19a1Q0VF58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Col19a1Q0VF58 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Col19a1Q0VF58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col19a1Q0VF58 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Col19a1Q0VF58 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col19a1Q0VF58 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Col19a1Q0VF58 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col19a1Q0VF58 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col19a1Q0VF58 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Col19a1Q0VF58 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col19a1Q0VF58 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col19a1Q0VF58 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Col19a1Q0VF58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col19a1Q0VF58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Col19a1Q0VF58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col19a1Q0VF58 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col19a1Q0VF58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col19a1Q0VF58 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col19a1Q0VF58 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Col19a1Q0VF58 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col19a1Q0VF58 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col19a1Q0VF58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col19a1Q0VF58 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col19a1Q0VF58 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col19a1Q0VF58 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col19a1Q0VF58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col19a1Q0VF58 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Col19a1Q0VF58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col19a1Q0VF58 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col19a1Q0VF58 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col19a1Q0VF58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col19a1Q0VF58 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col19a1Q0VF58 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col19a1Q0VF58 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms