Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd12Q0VE29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd12Q0VE29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd12Q0VE29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd12Q0VE29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd12Q0VE29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd12Q0VE29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samd12Q0VE29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd12Q0VE29 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd12Q0VE29 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd12Q0VE29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd12Q0VE29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd12Q0VE29 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd12Q0VE29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd12Q0VE29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd12Q0VE29 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd12Q0VE29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd12Q0VE29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd12Q0VE29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd12Q0VE29 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd12Q0VE29 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd12Q0VE29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd12Q0VE29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd12Q0VE29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd12Q0VE29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd12Q0VE29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd12Q0VE29 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd12Q0VE29 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd12Q0VE29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samd12Q0VE29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd12Q0VE29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd12Q0VE29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd12Q0VE29 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd12Q0VE29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd12Q0VE29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd12Q0VE29 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd12Q0VE29 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd12Q0VE29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms